女婴未满两周岁，通常归母亲抚养。依据《婚姻法》及相关司法解释，若无不宜由母亲抚养情形，如母亲有抚养能力且不存在不良生活状况，则三个月女婴应由母亲抚养，这有利于孩子成长。若不及时处理，可能导致孩子生活环境不稳定，影响其健康成长。
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处理方式因情况而异：1.若母亲具备抚养条件且愿意抚养，可优先由母亲抚养女婴。2.若双方均希望抚养，需通过协商或法律程序确定抚养权，考虑双方抚养能力及对孩子成长的有利性。3.若存在争议，应收集证据，通过法律途径解决，确保孩子抚养权得到妥善处理。
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常见处理方式为协商或诉讼。首先可尝试双方协商抚养权归属，若协商不成，则可通过法律途径提起诉讼，由法院判决。选择方式时应考虑效率、成本及对孩子的影响，优先以和平、快速解决为原则。